More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0224 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 419 aa  846    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  64.95 
 
 		 419 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  62.05 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  59.95 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  49.4 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  29.88 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  32.11 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  31.62 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.11 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  31.57 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.01 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.65 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1470 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 1496 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.93 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  28.77 
 
 		 576 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  30.24 
 
 		 627 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 738 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.82 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.46 
 
 		 488 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 462 aa  86.3  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  26.45 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.42 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0921  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  26.22 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  24.26 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  27.55 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  21.95 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.17 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.75 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.17 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  27.63 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.25 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.01 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.18 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.35 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.32 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  23.61 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>