104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4543 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 430 aa  853    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  30.49 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  24.19 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  21.52 
 
 		 463 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  20.88 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  20.22 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.14 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 1496 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  23.56 
 
 		 456 aa  67  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.92 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.65 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 972 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  23.32 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.72 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  28.66 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  24.12 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 627 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 565 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  27.05 
 
 		 731 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  21.05 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  20.46 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  21.74 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  23.38 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.08 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  21.43 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 535 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.28 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  32.67 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.91 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  19.73 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  30.41 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.61 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  22.99 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.82 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.67 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.73 
 
 		 874 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  25.13 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.78 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  22.09 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  21.26 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  32.33 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.37 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.37 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  26.71 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  22.81 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.15 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.05 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  23 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  21.33 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.08 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  21.76 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.64 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  22.79 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.38 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>