More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0041 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 457 aa  921    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  56 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  49.34 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  51.31 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  44.36 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 419 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  27.52 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 1496 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.36 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.36 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.22 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.87 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.11 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  34.46 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  23.6 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.36 
 
 		 522 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.61 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.12 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.45 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.49 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.07 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0921  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.69 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  19.91 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.81 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  22.87 
 
 		 576 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0166  outer membrane channel lipoprotein  26.37 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00297145  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.63 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0055  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.38 
 
 		 579 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.37 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1470 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  24.83 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.67 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.26 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  22.5 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  22.5 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  22.5 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.78 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.04 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.04 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.75 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.22 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.95 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  24.05 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.28 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.64 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  23.7 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.66 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.8 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.03 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.74 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  26.17 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.19 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  25.22 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.99 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  25.45 
 
 		 484 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  21.98 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>