249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4412 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 444 aa  878    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  35.39 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  29.75 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 441 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  26.28 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  27.06 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.54 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  25.42 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  25.18 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  25.18 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  24.94 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  25.18 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  25.18 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  25.18 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  25.18 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  19.37 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  23.67 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.71 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.84 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.84 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.84 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.07 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.84 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.84 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.93 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.63 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.41 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.68 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  21.63 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.65 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.77 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.19 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.52 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  23.78 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.82 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  27.07 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.91 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5636  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.513783  normal  0.540164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 460 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.65 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.61 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  26.2 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.1 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  22.61 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0820  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.46 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127613  normal  0.415526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3723  putative outer membrane protein  24.87 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  18.13 
 
 		 458 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  23.68 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.86 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  22.61 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 1496 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  23.95 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.65 
 
 		 497 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  20.41 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 447 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  22.77 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.38 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.2 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  22.77 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.51 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.17 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.18 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  22.29 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  23.8 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.67 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.31 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.69 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.38 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.04 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>