10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5636 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5636  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 421 aa  855    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.513783  normal  0.540164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2915  outer membrane efflux protein  48.31 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0124  outer membrane efflux protein  40.94 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.638422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2584  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423133  decreased coverage  0.00978547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  31.22 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  23.11 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>