14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0124 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0124  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 430 aa  864    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.638422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2915  outer membrane efflux protein  44.29 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5636  outer membrane efflux protein  40.94 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.513783  normal  0.540164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 445 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.77 
 
 		 553 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.2 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>