137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2559 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 445 aa  879    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.71 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.48 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.79 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  21.77 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.33 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.97 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.97 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  19.82 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.82 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.92 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.57 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  19.79 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  21.7 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.18 
 
 		 497 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.63 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  26.56 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.56 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  23.61 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0124  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.638422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.54 
 
 		 521 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  22.01 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.98 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0921  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.62 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 		 526 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.42 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.75 
 
 		 576 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  21.52 
 
 		 482 aa  47.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  22.12 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1737  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.1 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.98 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  20.39 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.28 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1627  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.19 
 
 		 538 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.94 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25.25 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.24 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 972 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.24 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.24 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  18.21 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>