85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1042 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 453 aa  923    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  66.37 
 
 		 453 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  64.05 
 
 		 452 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  48.12 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  35.9 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1897  putative Outer membrane protein  27.51 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0762  outer membrane efflux protein  28.71 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.32 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.78 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  22.29 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.96 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.01 
 
 		 1470 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  25.17 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  20.55 
 
 		 453 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.2 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 449 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.31 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0302  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.019197  normal  0.0220531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  24.33 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 627 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.05 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 1496 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 447 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0471  efflux system protein  25.74 
 
 		 514 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1405  hypothetical protein  25.74 
 
 		 514 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.48 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  26.21 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  28.14 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  20.56 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23 
 
 		 532 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  19.93 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.03 
 
 		 490 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  29.82 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  19.83 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  20.3 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  19.22 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 470 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.9 
 
 		 489 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>