183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2692 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 469 aa  926    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  31.25 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  30.22 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  28.79 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0762  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1897  putative Outer membrane protein  26.25 
 
 		 453 aa  123  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.33 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.86 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.17 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2139  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.95 
 
 		 517 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 516 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.04 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.55 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.1 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.65 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0753  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.13209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.1 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 1496 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.69 
 
 		 576 aa  57  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.83 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6455  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.31 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0715  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.59 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 635 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  23.08 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  25 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1710  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  26.72 
 
 		 519 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.733437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.01 
 
 		 531 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 731 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 497 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0749  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.84 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.62 
 
 		 521 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2069  multidrug efflux MFS outer membrane protein, putative  27.38 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4468  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 		 503 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  20.39 
 
 		 496 aa  53.9  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 443 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44210  multidrug efflux pump outer membrane lipoprotein  28.21 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.12 
 
 		 468 aa  53.5  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.13 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.43 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  20.38 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.45 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.59 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.5 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.2 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.43 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.17 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  24.63 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.54 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 627 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 421 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 489 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  21.76 
 
 		 437 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  30.24 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.55 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.5 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1470 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  24.57 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>