More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1015 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  100 
 
 
731 aa  1459    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  66.67 
 
 
635 aa  604  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  50 
 
 
972 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  48.69 
 
 
525 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  47.47 
 
 
565 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  58.02 
 
 
627 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  43.38 
 
 
578 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  43.38 
 
 
578 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  43.55 
 
 
576 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  34.5 
 
 
594 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  33.89 
 
 
577 aa  226  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  33.81 
 
 
574 aa  217  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
526 aa  167  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  27.92 
 
 
526 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  26.76 
 
 
505 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.37 
 
 
491 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 
1496 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 
460 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  27.33 
 
 
476 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 
1470 aa  105  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
453 aa  104  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.55 
 
 
470 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 
482 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
467 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 
535 aa  98.6  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 
471 aa  97.8  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  22.87 
 
 
477 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
420 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 
421 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  23.55 
 
 
475 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
421 aa  94  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  23.24 
 
 
475 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.28 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  21.49 
 
 
606 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 
441 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
427 aa  89.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 
435 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.56 
 
 
435 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 
463 aa  88.2  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 
439 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.24 
 
 
455 aa  87.8  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 
496 aa  87.8  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 
461 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 
433 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 
451 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 
738 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 
445 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 
426 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 
451 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.6 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.49 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
431 aa  77  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.85 
 
 
441 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.17 
 
 
431 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.33 
 
 
497 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
495 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 
476 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
509 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  23.94 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 
454 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
463 aa  73.9  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 
446 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
436 aa  70.5  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
447 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.34 
 
 
470 aa  70.5  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.13 
 
 
458 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.98 
 
 
497 aa  70.5  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 
419 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
476 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
479 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
476 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.28 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.49 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>