134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4130 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 516 aa  1045    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  60.55 
 
 		 488 aa  588  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  44.07 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  34.55 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.83 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  24.68 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.01 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 469 aa  67  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  21.94 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  26.58 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20.12 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.11 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 436 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.53 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.01 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  19.96 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1897  putative Outer membrane protein  20.78 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 424 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.76 
 
 		 533 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  18.64 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  26.35 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  22.22 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  26.71 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.36 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  28.5 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  26.78 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.04 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.05 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.2 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  20.4 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  20.21 
 
 		 442 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.41 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.65 
 
 		 453 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.19 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.12 
 
 		 489 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.76 
 
 		 537 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.61 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.34 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.86 
 
 		 489 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 449 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  22.18 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.1 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.79 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.51 
 
 		 576 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.33 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.84 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  26.56 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.24 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  21.15 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.94 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.21 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.23 
 
 		 509 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  18.5 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.36 
 
 		 469 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.61 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  20.06 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  20.48 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.65 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.2 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.23 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  28.66 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.04 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.53 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  22.3 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 508 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  21.47 
 
 		 439 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.99 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>