More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0594 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  99.78 
 
 
453 aa  912    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  913    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  100 
 
 
508 aa  1030    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  42.74 
 
 
527 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  41.81 
 
 
508 aa  340  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  40.43 
 
 
513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  39.7 
 
 
514 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  40.04 
 
 
509 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  40.67 
 
 
517 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  39.28 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  38.05 
 
 
520 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  39.28 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  39.28 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  39.09 
 
 
521 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  38.77 
 
 
515 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  38.56 
 
 
519 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.81 
 
 
452 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 
482 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.75 
 
 
479 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.5 
 
 
471 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.5 
 
 
479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
485 aa  110  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 
528 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
462 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  24.64 
 
 
488 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 
476 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
495 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
488 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  26.41 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.11 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.76 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.96 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.04 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.88 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  26.02 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.56 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  25.69 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.37 
 
 
1135 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  26.09 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.49 
 
 
500 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.53 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.93 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
505 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.01 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.01 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.01 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  28.01 
 
 
506 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  28.01 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.04 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  25.46 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  28.01 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.6 
 
 
501 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.08 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.51 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2066  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.31 
 
 
494 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.42 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.7 
 
 
491 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.1 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.68 
 
 
452 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.09 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.98 
 
 
486 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  27.44 
 
 
511 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  27.78 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.68 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.64 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.43 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  26.04 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.36 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.51 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  24.33 
 
 
504 aa  73.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.06 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  26.61 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.06 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.08 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.06 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  26.57 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  26 
 
 
496 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.85 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  30.38 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.87 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  23.52 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  24.23 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1341  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.31 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.02 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  26.22 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  26.45 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.28 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.54 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.02 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.45 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>