More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3594 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  89.6 
 
 
471 aa  885    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  87.74 
 
 
473 aa  865    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  87.74 
 
 
473 aa  865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
471 aa  966    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  90.23 
 
 
471 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  88.98 
 
 
472 aa  874    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  75.69 
 
 
470 aa  755    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  72.82 
 
 
469 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  75.48 
 
 
475 aa  751    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  73.25 
 
 
468 aa  713    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  88.14 
 
 
472 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  73.09 
 
 
472 aa  737    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  89.81 
 
 
471 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  89.81 
 
 
471 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  74.89 
 
 
470 aa  760    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  73.56 
 
 
469 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  42.03 
 
 
445 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  39.39 
 
 
437 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  41.65 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  41.82 
 
 
436 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  40.75 
 
 
440 aa  354  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  41.89 
 
 
423 aa  349  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  41.36 
 
 
425 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.61 
 
 
501 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.53 
 
 
431 aa  316  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  38.62 
 
 
430 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.52 
 
 
445 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.89 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.59 
 
 
450 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.67 
 
 
450 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.89 
 
 
450 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.24 
 
 
451 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.68 
 
 
456 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.02 
 
 
457 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.91 
 
 
457 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.36 
 
 
452 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.36 
 
 
452 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.14 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.36 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  34.54 
 
 
574 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  34.31 
 
 
574 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.75 
 
 
452 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.85 
 
 
484 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.24 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.79 
 
 
609 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.26 
 
 
491 aa  229  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.79 
 
 
471 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.45 
 
 
472 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.93 
 
 
607 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.21 
 
 
484 aa  216  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.42 
 
 
658 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.98 
 
 
633 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.63 
 
 
636 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.66 
 
 
444 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  32.51 
 
 
492 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.21 
 
 
450 aa  205  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.82 
 
 
450 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.41 
 
 
440 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.6 
 
 
451 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.17 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.72 
 
 
443 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.48 
 
 
472 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.11 
 
 
456 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 
566 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.51 
 
 
524 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  28.1 
 
 
559 aa  150  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27 
 
 
476 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.56 
 
 
475 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.01 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.55 
 
 
455 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.99 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 
456 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.39 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  27.07 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  27.15 
 
 
452 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.88 
 
 
460 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.69 
 
 
472 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  23.67 
 
 
438 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.43 
 
 
472 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  24.72 
 
 
425 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.57 
 
 
463 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.82 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.8 
 
 
487 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.28 
 
 
461 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.88 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.36 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.36 
 
 
464 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  24.66 
 
 
425 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.49 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.07 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.07 
 
 
488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  22.01 
 
 
469 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.82 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  21.93 
 
 
461 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.31 
 
 
488 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.79 
 
 
463 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.15 
 
 
538 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.53 
 
 
480 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.43 
 
 
428 aa  101  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.11 
 
 
478 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>