More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0921 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0921  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 435 aa  826    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  30.29 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.36 
 
 		 491 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  34.71 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  30.1 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.16 
 
 		 1496 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  30.75 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.16 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.89 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.57 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.39 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 467 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 479 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.79 
 
 		 471 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1470 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  29.89 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 472 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.88 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 569 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.45 
 
 		 576 aa  86.7  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.07 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 738 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  29.23 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.24 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.64 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.66 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.53 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.77 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  27.13 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  27.82 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.37 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 731 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 635 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.72 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.72 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>