More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0335 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  100 
 
 		 436 aa  865    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  48.56 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  52.39 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  50 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  48.6 
 
 		 439 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  47.29 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  39.03 
 
 		 438 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.38 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  29.07 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  29.07 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  29.07 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  29.07 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  30.49 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  29.07 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.06 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.11 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.44 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.22 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  29.47 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.43 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.18 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.79 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.15 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.64 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.5 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  24.91 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  22.8 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.7 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.33 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  23.39 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.33 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.9 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.42 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.88 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  25.24 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.27 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.52 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.75 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.26 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.64 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.33 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.83 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  25.99 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.57 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.09 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  27.16 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.86 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.6 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.02 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.02 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.4 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.02 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.6 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.27 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.86 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.37 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.27 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  24.49 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.27 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.72 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  23.04 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.42 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.94 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.14 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.49 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  26.49 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.49 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.49 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.49 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  26.49 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.94 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  26.49 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.8 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.39 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  26.49 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  26.49 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.57 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.39 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.04 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  26.49 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>