More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1145 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 439 aa  887    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  60.96 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  56.2 
 
 		 435 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  56.49 
 
 		 423 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  54.92 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  48.6 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  42.46 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.12 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  25.14 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  24.86 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.17 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.23 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.23 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  23.97 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  22.61 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  25.73 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.11 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  25.61 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.72 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.77 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  22.38 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.25 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.94 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  23.66 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.66 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  23.66 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.83 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.94 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.66 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.39 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.66 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.95 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  26.74 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.57 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.66 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.13 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.37 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.26 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.48 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.13 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.08 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  24.2 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.66 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.75 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  24.88 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.37 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.98 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.88 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.58 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.58 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.88 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.58 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.88 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.43 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  23.1 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.4 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.08 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.25 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.4 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.43 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.4 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.4 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.1 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.08 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  22.19 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 1496 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.81 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.11 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.71 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  23.72 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.4 
 
 		 529 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  22.6 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.2 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.93 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.74 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  21.87 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.76 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2739  putative outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1058  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.25 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.712242  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.41 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>