More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1946 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 431 aa  870    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  64.35 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  67 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  60.96 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  58.55 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  50.47 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  38.85 
 
 		 438 aa  279  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.04 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.64 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.16 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.16 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.65 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.6 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.06 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.09 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.03 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.41 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  24.47 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  25.35 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.56 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.12 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.98 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.16 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.67 
 
 		 493 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.48 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.88 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.67 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.08 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.42 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.6 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.35 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  24.22 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.94 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.61 
 
 		 514 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  23.7 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  24.92 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  24.92 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  24.92 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.31 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.88 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.61 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.06 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  23.22 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.24 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.98 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  25.12 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.42 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.74 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.86 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.83 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.29 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  23.91 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  22.65 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.93 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.73 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.14 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  21.76 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.84 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.43 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.67 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.13 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  26.23 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  24.13 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  27.5 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  19.79 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  28.01 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.47 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.11 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.78 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.92 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.3 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.94 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.3 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.7 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  23.98 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>