More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6208 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
497 aa  978    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  86.32 
 
 
497 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  66.3 
 
 
509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  64.72 
 
 
506 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  64.72 
 
 
508 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  64.72 
 
 
508 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  64.72 
 
 
508 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  64.72 
 
 
508 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  64.72 
 
 
508 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  60.89 
 
 
470 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  54.39 
 
 
495 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1686  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  52.8 
 
 
516 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108559  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.22 
 
 
493 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.42 
 
 
479 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.37 
 
 
496 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.58 
 
 
495 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.66 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1499  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.11 
 
 
502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.71 
 
 
499 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2359  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.04 
 
 
492 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477892  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.93 
 
 
495 aa  349  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.75 
 
 
471 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.21 
 
 
474 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.18 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.89 
 
 
485 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.01 
 
 
514 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.82 
 
 
475 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.01 
 
 
491 aa  333  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.61 
 
 
514 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.17 
 
 
489 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.59 
 
 
481 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  43.45 
 
 
499 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.46 
 
 
477 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.68 
 
 
489 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  41.54 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.28 
 
 
525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.95 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.63 
 
 
486 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.63 
 
 
486 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.61 
 
 
480 aa  326  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.34 
 
 
505 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.63 
 
 
495 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.38 
 
 
485 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.98 
 
 
487 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.11 
 
 
474 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  41.48 
 
 
467 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.54 
 
 
499 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.37 
 
 
492 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.91 
 
 
503 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.78 
 
 
474 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  41.1 
 
 
514 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.67 
 
 
500 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  44.66 
 
 
492 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.38 
 
 
517 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 
485 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.9 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.76 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.01 
 
 
507 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 
485 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  41.16 
 
 
485 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  40.55 
 
 
513 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  40.95 
 
 
485 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.48 
 
 
461 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.78 
 
 
471 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  40.34 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  40.34 
 
 
513 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  40.34 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.07 
 
 
507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.79 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.91 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.07 
 
 
507 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  42.61 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  42.61 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
514 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
514 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  42.61 
 
 
553 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  42.61 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.17 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.33 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.84 
 
 
519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38.84 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.31 
 
 
472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  42.61 
 
 
514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  42.61 
 
 
514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  42.61 
 
 
514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.75 
 
 
544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  42.54 
 
 
469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2254  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.8 
 
 
487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.83 
 
 
516 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  42.39 
 
 
512 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  41.43 
 
 
487 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  42.14 
 
 
491 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.88 
 
 
510 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.52 
 
 
462 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.51 
 
 
507 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.79 
 
 
508 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>