More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2686 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  100 
 
 		 472 aa  955    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  60.57 
 
 		 456 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  46.38 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.63 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  44.7 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  44.7 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.79 
 
 		 488 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.79 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.79 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.63 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.76 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.02 
 
 		 518 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.25 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.25 
 
 		 478 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.33 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.07 
 
 		 522 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.53 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.02 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.86 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.25 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  37.17 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.79 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.51 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  37.05 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  38.19 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.95 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.93 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.62 
 
 		 472 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.05 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  36.24 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.76 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.12 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.98 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.22 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.14 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  32.64 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.1 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.29 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.07 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  33.41 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.95 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.82 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.72 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.8 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.78 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.62 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.12 
 
 		 473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.66 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.27 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.12 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.47 
 
 		 464 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.76 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.58 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  27 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.97 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  25.52 
 
 		 436 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  27.38 
 
 		 425 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.76 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  24.02 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  25.29 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  27.02 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  24.33 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.09 
 
 		 636 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 466 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.93 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.62 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.24 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.49 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.73 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.44 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.2 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.76 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.76 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  24.35 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.23 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.23 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.04 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.65 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.04 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.76 
 
 		 609 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.28 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.51 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.29 
 
 		 607 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.11 
 
 		 524 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.49 
 
 		 658 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.6 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.39 
 
 		 484 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.43 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.43 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.07 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.28 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.11 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>