More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2832 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
520 aa  1057    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.76 
 
 
523 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.1 
 
 
490 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.89 
 
 
539 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  49.47 
 
 
538 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.77 
 
 
523 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.96 
 
 
536 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.94 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.51 
 
 
520 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.13 
 
 
523 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.73 
 
 
523 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.73 
 
 
523 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  44.42 
 
 
497 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.51 
 
 
509 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.36 
 
 
527 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.76 
 
 
495 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.07 
 
 
487 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.57 
 
 
516 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.68 
 
 
501 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.78 
 
 
486 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.68 
 
 
501 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.4 
 
 
485 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.28 
 
 
471 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.27 
 
 
509 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.47 
 
 
495 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.56 
 
 
509 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  43.61 
 
 
508 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  43.67 
 
 
490 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  41.52 
 
 
499 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.39 
 
 
497 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  41.6 
 
 
498 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.77 
 
 
496 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.88 
 
 
489 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.67 
 
 
509 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.28 
 
 
486 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 
532 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116947  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.28 
 
 
500 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.24 
 
 
497 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.55 
 
 
477 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.94 
 
 
514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.54 
 
 
515 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  0.820801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.94 
 
 
514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.44 
 
 
496 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  42.83 
 
 
496 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.83 
 
 
496 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38 
 
 
511 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.57 
 
 
512 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
501 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4418  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
496 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
497 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.33 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.26 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.39 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.12 
 
 
492 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.76 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 
500 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.34 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2417  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.38 
 
 
479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118165  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  39.38 
 
 
479 aa  312  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.2 
 
 
486 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.99 
 
 
533 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.26 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.29 
 
 
521 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.81 
 
 
537 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.59 
 
 
516 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.86 
 
 
474 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.93 
 
 
478 aa  302  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0124  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.85 
 
 
525 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.44 
 
 
478 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.49 
 
 
498 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.32 
 
 
477 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3362  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.2 
 
 
489 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0212058  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40 
 
 
503 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.27 
 
 
482 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.32 
 
 
517 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 
510 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.87 
 
 
508 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  39.05 
 
 
510 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  39.05 
 
 
510 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 
510 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.74 
 
 
502 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  39.05 
 
 
510 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  39.05 
 
 
510 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.76 
 
 
469 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14360  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38 
 
 
507 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10675  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.45 
 
 
510 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 
500 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.72 
 
 
511 aa  286  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.58 
 
 
484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.71 
 
 
513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.58 
 
 
484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.58 
 
 
510 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.58 
 
 
510 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>