More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5578 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 451 aa  916    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  31.56 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  34.97 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  28.7 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  31.68 
 
 		 463 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  29.33 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  24.03 
 
 		 463 aa  91.3  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 565 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.68 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.76 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 1496 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  23.06 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.06 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  23.06 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.06 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  23.06 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  22.7 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  23.06 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.39 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.39 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  21.78 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1470 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.85 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 731 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.94 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.88 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.71 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.56 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.81 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.81 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.81 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.71 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.99 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.35 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.81 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  22.12 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.31 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5228  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.56 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.33 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.34 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.34 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.7 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.44 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.65 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.48 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.81 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0692116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  22.22 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  19.23 
 
 		 972 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.54 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.54 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  21.6 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.54 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  19.1 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.41 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.65 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  23.08 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>