140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1293 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 442 aa  887    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  62.25 
 
 		 449 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  30.37 
 
 		 433 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  27.88 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  29.93 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  29.51 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  26.72 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.56 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.47 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.88 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.69 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.25 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.26 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.08 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.48 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  27.03 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  21.99 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26.65 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  23.35 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  21.93 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.53 
 
 		 1480 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.92 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  20.21 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  22.69 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  22.93 
 
 		 418 aa  57  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.23 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  22.69 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  22.69 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  22.69 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  22.69 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  22.69 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  22.69 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  27.25 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  22.94 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  20.21 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  22.02 
 
 		 458 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 489 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.19 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  24.6 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  26.69 
 
 		 426 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  26.54 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  25.56 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  24.49 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>