144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4485 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 417 aa  836    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  44.69 
 
 		 418 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  37.83 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  32.62 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 438 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 479 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.35 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.81 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  19.63 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  19.63 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  21.64 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  20.21 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.31 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  19.11 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  21.52 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  22.25 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  19.36 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  22.86 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  21.88 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  20.39 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  22.64 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.46 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  20.86 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  20.86 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  20.86 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  20.86 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  20.86 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  20.86 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  20.86 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  20.59 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  22.49 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  20.38 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2326  hypothetical protein  32.17 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  23.08 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.56 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  21.94 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  20.21 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.17 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  23.38 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  22.14 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.61 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.84 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  18.67 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  19.11 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  23.71 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  24.68 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  22.36 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  25.22 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  23.91 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  18.91 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  20.1 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 495 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  23.31 
 
 		 470 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  23.93 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  20.49 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.5 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.82 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.44 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.32 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.65 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.65 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.28 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>