93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4056 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 416 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  67.76 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  52.77 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  50.24 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  39.1 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  35.19 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  36.23 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  33.58 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  30.25 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  29.28 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  30.02 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.94 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.13 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.42 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.83 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.99 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.72 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  25.59 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  23.45 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  22.99 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.15 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  25.46 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  22.9 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.91 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 431 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  21.67 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  22.22 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  20.9 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  26.45 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.95 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.98 
 
 		 1469 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  23.02 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  23.02 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0372  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.02 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.088852 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  23.02 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  23.02 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  23.02 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  23.02 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  25.4 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  20.3 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.66 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.27 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  hitchhiker  0.00908583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>