122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0790 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 423 aa  852    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.8 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.07 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.8 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.75 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.32 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  20.94 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  25.31 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.65 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  20.5 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.32 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.19 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.56 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  23.46 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.53 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  21.22 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  18.93 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  26.4 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  21.25 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  21.25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  21.25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  21.25 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  21.25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  21.25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  21.13 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  19.9 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  28.93 
 
 		 485 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  20.98 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  21.89 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  23.33 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.95 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6515  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.38 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.56 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.77 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.59 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.97 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  19.24 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.98 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  22.4 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  20.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  26.52 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4373  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.34 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.73 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  19.95 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  23.41 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.67 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.37 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.02 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.13 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.034745  normal  0.935873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>