36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3231 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  100 
 
 		 416 aa  846    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  32.99 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  31.91 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  34.91 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  20.56 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  23.16 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  20.12 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  21.03 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  19.9 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  22.5 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  20.06 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  19.63 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  19.14 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  18.73 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  19.79 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>