164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01101 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  100 
 
 		 505 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  50.55 
 
 		 526 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  51.49 
 
 		 526 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  40.34 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  38.48 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  38.19 
 
 		 577 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  36.05 
 
 		 476 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  36.79 
 
 		 477 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  36.21 
 
 		 475 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  35.31 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  33.65 
 
 		 606 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  31.45 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 972 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 731 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 525 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 635 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 565 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 627 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 578 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 578 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  22.12 
 
 		 391 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  32.54 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.79 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.51 
 
 		 1470 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.41 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  20.24 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.86 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  19.9 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  22.97 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.76 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.53 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  21.14 
 
 		 503 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 523 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.99 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.23 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  19.63 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  18.77 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  29.03 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  20.66 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  19.95 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  20.74 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3706  RND efflux system outer membrane lipoprotein  18.58 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  19.43 
 
 		 522 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  19.65 
 
 		 470 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  20.74 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  19.94 
 
 		 558 aa  50.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  18.89 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.58 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  23.97 
 
 		 499 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  18.41 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  20.62 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.86 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  20.09 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.87 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.12 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  19.3 
 
 		 514 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.54 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>