167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1027 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  100 
 
 
452 aa  933    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 
467 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
470 aa  179  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
463 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  27 
 
 
465 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
464 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
517 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  27.27 
 
 
463 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 
489 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 
489 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
489 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  27.17 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
493 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
489 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 
473 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  27.92 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
471 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 
587 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
457 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 
583 aa  123  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.39 
 
 
491 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 
449 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 
515 aa  78.2  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.63 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 
408 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 
627 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
483 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  21.49 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  19.43 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 
448 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.91 
 
 
470 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
438 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 
459 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.7 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
455 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 
417 aa  63.9  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
972 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 
455 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 
496 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  19.82 
 
 
455 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  20.44 
 
 
419 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 
449 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 
460 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  20.8 
 
 
440 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 
426 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  21.51 
 
 
576 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 
462 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.99 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.11 
 
 
455 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
420 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
467 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  18.22 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 
441 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  20.28 
 
 
423 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  19.85 
 
 
635 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  22.88 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  23 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
438 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
451 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  20.83 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 
463 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.06 
 
 
489 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  20.32 
 
 
447 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  19.02 
 
 
364 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.59 
 
 
463 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 
454 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
445 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
442 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>