61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4572 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 483 aa  940    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  40.35 
 
 		 587 aa  324  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  37.58 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  31.47 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  31.69 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  31.07 
 
 		 464 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  29.28 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  30.72 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  28.41 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  35.12 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  28.73 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  28.7 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  30.26 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 489 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 473 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 489 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  29.25 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  29.39 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.56 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 454 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.61 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 447 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 526 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 635 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  29.27 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 528 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 738 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 559 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 523 aa  43.5  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>