More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1477 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  94.71 
 
 
454 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  94.27 
 
 
454 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  100 
 
 
454 aa  849    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  50.12 
 
 
455 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  50 
 
 
463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  50 
 
 
456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  47.67 
 
 
497 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  46.17 
 
 
477 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  46.17 
 
 
477 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  45.54 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  37.5 
 
 
508 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  36.5 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  37.23 
 
 
443 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  36.74 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  29.98 
 
 
491 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  35.1 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.32 
 
 
441 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  32.9 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  33.61 
 
 
445 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 
419 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  27.67 
 
 
463 aa  90.1  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
419 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  29.74 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.43 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 
627 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  30.04 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.18 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  31.15 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.3 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  30 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 
473 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 
447 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.88 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.17 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
489 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 
496 aa  66.6  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  24.5 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 
483 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 
458 aa  65.1  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
972 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.23 
 
 
444 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.23 
 
 
444 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  22.8 
 
 
463 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  30.04 
 
 
447 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 
453 aa  63.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 
423 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.39 
 
 
513 aa  63.2  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 
463 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
501 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  29.48 
 
 
497 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.63 
 
 
480 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 
448 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.21 
 
 
488 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
594 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.22 
 
 
576 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25 
 
 
731 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 
455 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>