More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1186 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  93.42 
 
 		 477 aa  681    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 480 aa  910    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  93.13 
 
 		 477 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  42.03 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  42.45 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  42.45 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  45.56 
 
 		 454 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  45.79 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  45.77 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  39.06 
 
 		 497 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  31.01 
 
 		 508 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  34.22 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  33.19 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.95 
 
 		 491 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 497 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.66 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  28.66 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.55 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  29.56 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.08 
 
 		 477 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.7 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.7 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.7 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.92 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.82 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 627 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.94 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.22 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  25.23 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 1496 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.87 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.27 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.27 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.55 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6576  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.76 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.034745  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6290  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.08 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  29.55 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  22.24 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.16 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  35.92 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.41 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.02 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6141  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.92 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.9 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.9 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.22 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.54 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3299  outer membrane lipoprotein  34.87 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.92 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.22 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.92 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.780445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.36 
 
 		 523 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.37 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.72 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.88 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.88 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.71 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6346  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.97 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.46 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.37 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  27.27 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.8 
 
 		 495 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.728729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  27.15 
 
 		 498 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>