More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3304 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  99.09 
 
 		 440 aa  813    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  92.61 
 
 		 443 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 440 aa  821    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  64.58 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  34.04 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  34.41 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  34.41 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  36.71 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  36.74 
 
 		 454 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  36.39 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  32.5 
 
 		 497 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  34.35 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 498 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  27.32 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2238  outer membrane efflux protein  31.05 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  33.86 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  33.41 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.75 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.96 
 
 		 509 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.83 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1709  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  29.89 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  29.76 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  30.06 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1636  outer membrane efflux protein  30.29 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.38 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.17 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  29.06 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  29.25 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  28.24 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.98 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 731 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.96 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 577 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  26.38 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  26.62 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.61 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1022  outer membrane efflux protein  30.6 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.35 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953441  normal  0.0124942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6346  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.15 
 
 		 491 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.78 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  30.43 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.84 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  27.47 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  26.52 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.43 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.79 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.06 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.49 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  27.65 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.93 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.93 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  26.12 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.94 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.47 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.18 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  28.13 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.84 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.31 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.1 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.79 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.15 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.27 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.27 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.3 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  26.48 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.45 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2417  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.83 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.35 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.62 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.36 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.45 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.9 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.034745  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.23 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  30.94 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2164  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.73 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>