88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1709 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1709  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 440 aa  846    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2238  outer membrane efflux protein  94.08 
 
 		 440 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1636  outer membrane efflux protein  98.18 
 
 		 440 aa  827    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1022  outer membrane efflux protein  66.04 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  31.45 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  31.49 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.15 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  29.17 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.9 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4126  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.48 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  31.38 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.24 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.94 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.92 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.64 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.53 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.62 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.62 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.62 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.74 
 
 		 494 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 738 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.83 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.12 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.25 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.6 
 
 		 531 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  29.96 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.38 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.22 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.96 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  25.62 
 
 		 514 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 497 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0868  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.34 
 
 		 526 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.61 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.23 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  28.37 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.68 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.69 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.04 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.96 
 
 		 495 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.25 
 
 		 480 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2115  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.14 
 
 		 497 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.67 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.34 
 
 		 576 aa  47.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  32.41 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  22.25 
 
 		 479 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  27.87 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.1 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3525  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.09 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.54 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  29.31 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.24 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.58 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.35 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  26.99 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  29.31 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  29.31 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  29.31 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  29.31 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.86 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.86 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.38 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  28.97 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  34.21 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4373  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.91 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  22.01 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.04 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.12 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.8 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.04 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.04 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 569 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.75 
 
 		 486 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.56 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.77 
 
 		 525 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.51 
 
 		 497 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.81 
 
 		 482 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>