More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1591 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
481 aa  972    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.68 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
477 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.18 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.18 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
496 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.57 
 
 
489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.04 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.45 
 
 
504 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.76 
 
 
472 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.89 
 
 
496 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.68 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.09 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.25 
 
 
496 aa  282  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.78 
 
 
495 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.5 
 
 
464 aa  279  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  37.47 
 
 
498 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.7 
 
 
489 aa  274  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  38.48 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  36.93 
 
 
499 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  38.27 
 
 
485 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.11 
 
 
482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.52 
 
 
489 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.09 
 
 
487 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.52 
 
 
495 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.82 
 
 
476 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.37 
 
 
485 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.2 
 
 
481 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.86 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.86 
 
 
512 aa  263  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.17 
 
 
478 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.37 
 
 
471 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.7 
 
 
470 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.63 
 
 
507 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.74 
 
 
480 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.82 
 
 
505 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.2 
 
 
485 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.64 
 
 
474 aa  257  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  36.64 
 
 
490 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.89 
 
 
507 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  35.93 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.88 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.73 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.53 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.64 
 
 
485 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.03 
 
 
482 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.03 
 
 
500 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.84 
 
 
461 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.07 
 
 
486 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.41 
 
 
507 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 
480 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.83 
 
 
507 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.83 
 
 
507 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  36.76 
 
 
499 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  36.7 
 
 
467 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 
492 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.56 
 
 
497 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 
485 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.94 
 
 
501 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.9 
 
 
477 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.84 
 
 
482 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  38.01 
 
 
470 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.41 
 
 
531 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.47 
 
 
486 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.14 
 
 
483 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.47 
 
 
486 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 
511 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  35.62 
 
 
479 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.02 
 
 
496 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.02 
 
 
496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  36.24 
 
 
504 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  36.82 
 
 
491 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  36.9 
 
 
514 aa  246  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.49 
 
 
509 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  34.81 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.97 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.58 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  34.68 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.65 
 
 
516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.9 
 
 
544 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  34.58 
 
 
511 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.76 
 
 
484 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.38 
 
 
474 aa  243  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.76 
 
 
484 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.85 
 
 
514 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.06 
 
 
515 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  34.03 
 
 
479 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.38 
 
 
499 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.85 
 
 
514 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.02 
 
 
492 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.25 
 
 
477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.55 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.34 
 
 
483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.62 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.8 
 
 
499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.31 
 
 
510 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  32.9 
 
 
479 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>