More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0412 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  64.84 
 
 
496 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
477 aa  958    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  77.47 
 
 
496 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  54.89 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  54.89 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.96 
 
 
486 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.33 
 
 
504 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.52 
 
 
472 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.64 
 
 
461 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  47.88 
 
 
486 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.13 
 
 
482 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.86 
 
 
464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.02 
 
 
480 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.25 
 
 
481 aa  315  8e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  41.58 
 
 
485 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.27 
 
 
489 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  41.15 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.13 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  39.1 
 
 
499 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.69 
 
 
478 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.65 
 
 
486 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.39 
 
 
486 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.13 
 
 
474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.15 
 
 
471 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 
495 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  38.34 
 
 
486 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.68 
 
 
477 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.39 
 
 
470 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.8 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.43 
 
 
531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.32 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2043  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.83 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.186335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.23 
 
 
484 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.25 
 
 
517 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.14 
 
 
501 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.64 
 
 
477 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.34 
 
 
473 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.16 
 
 
482 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.39 
 
 
500 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.75 
 
 
484 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.75 
 
 
484 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 
505 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.75 
 
 
484 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.16 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.41 
 
 
525 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.8 
 
 
469 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.83 
 
 
480 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
476 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 
515 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  36.3 
 
 
470 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.93 
 
 
495 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.27 
 
 
460 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.61 
 
 
482 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.77 
 
 
459 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.7 
 
 
470 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.19 
 
 
496 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.48 
 
 
492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.67 
 
 
499 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  34.82 
 
 
474 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.95 
 
 
489 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1686  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.93 
 
 
516 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108559  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  37.26 
 
 
512 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  36.79 
 
 
491 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.05 
 
 
460 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  36.51 
 
 
514 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 
483 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.6 
 
 
482 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.48 
 
 
481 aa  256  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  37.47 
 
 
487 aa  256  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.41 
 
 
460 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51570  multidrug efflux pump RND-family outer membrane protein  36.86 
 
 
505 aa  256  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0329698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.11 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.78 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.4 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.34 
 
 
455 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.97 
 
 
480 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  35.91 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.91 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.12 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  35.91 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.91 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.91 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  33.97 
 
 
497 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.42 
 
 
480 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.68 
 
 
507 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.24 
 
 
543 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.17 
 
 
479 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.24 
 
 
519 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
507 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  34.18 
 
 
501 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.19 
 
 
507 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.05 
 
 
510 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.05 
 
 
507 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  38.38 
 
 
492 aa  249  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
507 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.64 
 
 
518 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  34.11 
 
 
461 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  36.82 
 
 
512 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  35.28 
 
 
485 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>