More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2780 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 477 aa  909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  97.69 
 
 		 477 aa  727    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  93.29 
 
 		 480 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  42.73 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  42.89 
 
 		 463 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  42.89 
 
 		 456 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  46.05 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  47.16 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  46.6 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  40.18 
 
 		 497 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  31.46 
 
 		 508 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  34 
 
 		 440 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  32.96 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  33.56 
 
 		 440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.73 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  28.2 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.55 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  21.84 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.04 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 1496 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  25.6 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.24 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.73 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.16 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.16 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5656  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162521  normal  0.0223313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.73 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.53 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.56 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  28.1 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  18.93 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.47 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.47 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.56 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.35 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  33.17 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.99 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3299  outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6576  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.62 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6290  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.92 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  35.21 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.32 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.72 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.51 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.780445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6141  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.51 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.51 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 972 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.17 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.3 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.36 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.88 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.88 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.14 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 517 aa  57  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.43 
 
 		 504 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>