More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3232 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  91.52 
 
 		 527 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.45 
 
 		 538 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.45 
 
 		 538 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.31 
 
 		 509 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.66 
 
 		 538 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  73.67 
 
 		 536 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  91.77 
 
 		 520 aa  799    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.21 
 
 		 523 aa  876    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.15 
 
 		 523 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 523 aa  1030    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.86 
 
 		 539 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  72.65 
 
 		 523 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  81.66 
 
 		 538 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  73.5 
 
 		 523 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  81.66 
 
 		 538 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.45 
 
 		 538 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  95.21 
 
 		 523 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.45 
 
 		 538 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  53.88 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.23 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.23 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  51.77 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  51.27 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.45 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  51.27 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.74 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.05 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.74 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.3 
 
 		 509 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.18 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.91 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.15 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.72 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.34 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.73 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  48.48 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.13 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  48.33 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.54 
 
 		 496 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.54 
 
 		 496 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.76 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.58 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.68 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.81 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.5 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.99 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.34 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.11 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.77 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.79 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.2 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 501 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.2 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.58 
 
 		 478 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.49 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.7 
 
 		 492 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 		 488 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.84 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.84 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4418  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.89 
 
 		 496 aa  353  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.95 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.76 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14360  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.95 
 
 		 507 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.79 
 
 		 515 aa  343  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  0.820801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.89 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.89 
 
 		 532 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116947  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.23 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.98 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.49 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2417  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.57 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.63 
 
 		 469 aa  329  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  38.77 
 
 		 479 aa  316  5e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3362  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.98 
 
 		 489 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0212058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.15 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.82 
 
 		 514 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259166  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.74 
 
 		 471 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.48 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.25 
 
 		 521 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.1 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.42 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.42 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.82 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.3 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.67 
 
 		 502 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  40.62 
 
 		 510 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  40.62 
 
 		 510 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  40.62 
 
 		 510 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  40.5 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.5 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.04 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.07 
 
 		 533 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.85 
 
 		 517 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  40.21 
 
 		 483 aa  296  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.14 
 
 		 516 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.08 
 
 		 513 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.71 
 
 		 513 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5874  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.09 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.63 
 
 		 511 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>