More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3362 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3362  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
489 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0212058  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  80.68 
 
 
492 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.86 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.22 
 
 
471 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.73 
 
 
488 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.35 
 
 
488 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.35 
 
 
488 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.85 
 
 
482 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 
464 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.86 
 
 
500 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.49 
 
 
485 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.3 
 
 
495 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  43.53 
 
 
508 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.8 
 
 
509 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.87 
 
 
495 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  40.21 
 
 
499 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.79 
 
 
487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.84 
 
 
501 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.84 
 
 
501 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  39.83 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  41.81 
 
 
490 aa  336  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.54 
 
 
489 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.92 
 
 
523 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.83 
 
 
497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  39.11 
 
 
479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.72 
 
 
496 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.72 
 
 
496 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  41.51 
 
 
496 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.77 
 
 
486 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.05 
 
 
523 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.42 
 
 
514 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.42 
 
 
514 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.97 
 
 
512 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.2 
 
 
509 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.49 
 
 
536 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.64 
 
 
539 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.61 
 
 
497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.17 
 
 
486 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.2 
 
 
520 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.76 
 
 
538 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.79 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.48 
 
 
477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
523 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.98 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.1 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.95 
 
 
497 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.52 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
523 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 
471 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.52 
 
 
509 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.08 
 
 
520 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 
516 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41 
 
 
469 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.46 
 
 
502 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5874  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.59 
 
 
498 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109065  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.75 
 
 
497 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2718  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.81 
 
 
531 aa  289  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 
521 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0124  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
525 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.04 
 
 
527 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4291  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 
503 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4075  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.59 
 
 
503 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.09 
 
 
490 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2954  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.77 
 
 
534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.61 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303935  normal  0.0862047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.07 
 
 
488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4187  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.3 
 
 
504 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164619  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.38 
 
 
484 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.38 
 
 
484 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.41 
 
 
500 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.57 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.52 
 
 
516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  38.69 
 
 
483 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 
478 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.23 
 
 
503 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.63 
 
 
502 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.33 
 
 
590 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.7 
 
 
533 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.71 
 
 
537 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  40.33 
 
 
493 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4314  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.47 
 
 
515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  0.820801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1728  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.78 
 
 
509 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141114  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
508 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.51 
 
 
478 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.29 
 
 
500 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.69 
 
 
532 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116947  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.78 
 
 
504 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0692116  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.8 
 
 
486 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0176  outer membrane efflux protein  33.82 
 
 
536 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.22 
 
 
510 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  38.22 
 
 
510 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  38.22 
 
 
510 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>