More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2479 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  97.14 
 
 
454 aa  679    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  100 
 
 
454 aa  850    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  94.27 
 
 
454 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  50.12 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  50 
 
 
456 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  50 
 
 
463 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  47.67 
 
 
497 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  46.84 
 
 
477 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  46.84 
 
 
477 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  45.77 
 
 
480 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  37.35 
 
 
508 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 
443 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  36.74 
 
 
440 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  37.23 
 
 
440 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  31.42 
 
 
491 aa  123  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  36.39 
 
 
445 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  36.08 
 
 
440 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  35.19 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  32.79 
 
 
457 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.23 
 
 
441 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 
471 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
441 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
441 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 
455 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  27.65 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 
440 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  26.87 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 
565 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 
627 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  30.37 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
470 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 
473 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  28.45 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
467 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.86 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  19.17 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.08 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.13 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  29.13 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.13 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  29.85 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  23.64 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.18 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 
972 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
489 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.98 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  25 
 
 
465 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.76 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 
467 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.19 
 
 
480 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 
483 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.47 
 
 
488 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 
497 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.32 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  24.85 
 
 
594 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 
455 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.51 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>