More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1390 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  100 
 
 
463 aa  953    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  35.33 
 
 
458 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  22.89 
 
 
446 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.94 
 
 
470 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  22.75 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 
515 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 
473 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 
473 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 
452 aa  103  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 
471 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
497 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 
448 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 
421 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
431 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
470 aa  90.5  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
471 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
431 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.67 
 
 
491 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.23 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
440 aa  88.2  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 
449 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  23.1 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  23.27 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
1496 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  22.93 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  20.27 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  20.09 
 
 
731 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 
627 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.8 
 
 
455 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.27 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.25 
 
 
1470 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 
635 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.32 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.26 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  19.64 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.49 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 
441 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  28.15 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  20.71 
 
 
488 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  20.55 
 
 
467 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.97 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.15 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  25 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 
461 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  21.46 
 
 
483 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 
433 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 
480 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 
535 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  22.94 
 
 
576 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 
463 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  20 
 
 
972 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.15 
 
 
471 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 
482 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 
517 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.31 
 
 
501 aa  63.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 
471 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  21.35 
 
 
451 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 
525 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>