79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1040 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 583 aa  1185    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  57.77 
 
 		 587 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  38 
 
 		 483 aa  276  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  28.07 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  27.94 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  29.55 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  28.63 
 
 		 473 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  31.61 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 493 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  30.7 
 
 		 477 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  31.19 
 
 		 463 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  31.72 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  31.72 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  31.72 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  27.25 
 
 		 476 aa  143  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 467 aa  143  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  30.63 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 470 aa  124  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 452 aa  124  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.58 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 1496 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.57 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.25 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 627 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 417 aa  54.3  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 441 aa  53.9  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.99 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 523 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 535 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 635 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 421 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.3 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 423 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  20.89 
 
 		 426 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.18 
 
 		 444 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.57 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  23.93 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.3 
 
 		 469 aa  47.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  23.68 
 
 		 481 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 441 aa  47.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.43 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4418  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.25 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.641884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  19.91 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0738  major facilitator superfamily multidrug efflux pump, outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  31.43 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  28.72 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 462 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  30.48 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>