More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0738 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4496  RND efflux system outer membrane lipoprotein  79.05 
 
 
484 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129506  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4418  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  94.55 
 
 
477 aa  852    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.641884  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0738  major facilitator superfamily multidrug efflux pump, outer membrane lipoprotein  100 
 
 
477 aa  944    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280425  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3770  RND efflux system outer membrane lipoprotein  66.1 
 
 
480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658463 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3753  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.67 
 
 
480 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4610  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  65.67 
 
 
480 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3630  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.78 
 
 
480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844951  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5484  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.88 
 
 
484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2346  RND efflux system outer membrane lipoprotein  66.09 
 
 
478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4977  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.25 
 
 
476 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  32.37 
 
 
479 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.85 
 
 
494 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  31.68 
 
 
479 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  31.95 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.18 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.58 
 
 
521 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.81 
 
 
511 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2582  hypothetical protein  30.27 
 
 
520 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.24 
 
 
477 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 
569 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.81 
 
 
475 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2436  hypothetical protein  29.71 
 
 
520 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.77 
 
 
501 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  33.13 
 
 
511 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.01 
 
 
502 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  30.98 
 
 
504 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.83 
 
 
470 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  30.4 
 
 
479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.15 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.52 
 
 
482 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.58 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.93 
 
 
513 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.04 
 
 
461 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.24 
 
 
497 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.62 
 
 
483 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  30.74 
 
 
520 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.18 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6853  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.05 
 
 
491 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  31.58 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2954  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.15 
 
 
534 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.66 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2718  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.29 
 
 
531 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2483  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.39 
 
 
486 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183146  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  29.14 
 
 
558 aa  176  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.52 
 
 
496 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.52 
 
 
496 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.96 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  28 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.87 
 
 
486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5748  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.89 
 
 
508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472679  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  28 
 
 
479 aa  174  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.62 
 
 
472 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.06 
 
 
495 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.26 
 
 
504 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.84 
 
 
497 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.49 
 
 
489 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.77 
 
 
486 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.29 
 
 
483 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2680  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.94 
 
 
490 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
485 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2816  outer membrane efflux family protein  31.12 
 
 
482 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.719657  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5103  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.7 
 
 
502 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.42 
 
 
495 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.86 
 
 
560 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.84 
 
 
541 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.36 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  30.82 
 
 
512 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.67 
 
 
482 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.02 
 
 
483 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  32.71 
 
 
499 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.17 
 
 
487 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.12 
 
 
533 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.13 
 
 
521 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  29.44 
 
 
483 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.17 
 
 
484 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.93 
 
 
484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1871  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.2 
 
 
485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.25 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.79 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  32.44 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.17 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.17 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1281  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.08 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5539  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.66 
 
 
503 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.541532  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  30.57 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.19 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  30.57 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6550  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.86 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.57 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  30.57 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  30.57 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0176  outer membrane efflux protein  29.57 
 
 
536 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.04 
 
 
489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.66 
 
 
503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.918566  hitchhiker  0.00837312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.34 
 
 
523 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3623  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.66 
 
 
503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.49 
 
 
514 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.21 
 
 
518 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.35 
 
 
520 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>