More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4496 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4496  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
484 aa  971    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129506  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0738  major facilitator superfamily multidrug efflux pump, outer membrane lipoprotein  78.19 
 
 
477 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280425  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4418  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  77.05 
 
 
477 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.641884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3770  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.6 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4610  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  63.6 
 
 
480 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2346  RND efflux system outer membrane lipoprotein  64.35 
 
 
478 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3753  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.6 
 
 
480 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3630  RND efflux system outer membrane lipoprotein  62.5 
 
 
480 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844951  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5484  RND efflux system outer membrane lipoprotein  61.59 
 
 
484 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4977  RND efflux system outer membrane lipoprotein  61.4 
 
 
476 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  31.55 
 
 
479 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.97 
 
 
521 aa  210  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 
569 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  30.82 
 
 
479 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.32 
 
 
517 aa  202  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  30.65 
 
 
503 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.67 
 
 
475 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.26 
 
 
501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.88 
 
 
511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6853  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.74 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.4 
 
 
483 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  31.78 
 
 
479 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2582  hypothetical protein  28.89 
 
 
520 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.95 
 
 
477 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.33 
 
 
509 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.89 
 
 
512 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  31.75 
 
 
504 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.02 
 
 
497 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  30.82 
 
 
511 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2436  hypothetical protein  28.34 
 
 
520 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.84 
 
 
513 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.52 
 
 
482 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2816  outer membrane efflux family protein  32.98 
 
 
482 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.719657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  31.17 
 
 
520 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2483  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.16 
 
 
486 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183146  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.16 
 
 
495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.36 
 
 
533 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.57 
 
 
494 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.61 
 
 
515 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.04 
 
 
472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.5 
 
 
560 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.5 
 
 
482 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5103  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.83 
 
 
502 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2954  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.6 
 
 
534 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1281  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.71 
 
 
561 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  29.55 
 
 
479 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.27 
 
 
541 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.27 
 
 
496 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.27 
 
 
496 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6550  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.5 
 
 
561 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  32.84 
 
 
486 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.65 
 
 
486 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.64 
 
 
486 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 
495 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  30.22 
 
 
547 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.28 
 
 
487 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2680  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.1 
 
 
490 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
494 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5642  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.65 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.51 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  26.95 
 
 
558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  27.83 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.98 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
486 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1871  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.83 
 
 
485 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6290  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.68 
 
 
486 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.69 
 
 
495 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.6 
 
 
461 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  27.71 
 
 
479 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.48 
 
 
546 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.68 
 
 
518 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6272  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.22 
 
 
558 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.397121 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6558  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.05 
 
 
591 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2426  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.99 
 
 
487 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.335348  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  30.43 
 
 
497 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.64 
 
 
495 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5539  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
503 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.541532  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0284  outer membrane efflux family protein  26.08 
 
 
518 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552621  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
503 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.918566  hitchhiker  0.00837312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5748  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.35 
 
 
508 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472679  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3623  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.81 
 
 
503 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.02 
 
 
485 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  29.92 
 
 
512 aa  170  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.11 
 
 
521 aa  170  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6576  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 
486 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189309  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.99 
 
 
495 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2718  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.98 
 
 
531 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4060  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.42 
 
 
492 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.24 
 
 
483 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0124  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.05 
 
 
525 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.16 
 
 
510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.36 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1481  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.74 
 
 
491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.290116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.74 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.86 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  30.16 
 
 
510 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  30.16 
 
 
510 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.16 
 
 
510 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>