More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2924 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 511 aa  1020    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  93.54 
 
 		 511 aa  958    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2526  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.78 
 
 		 504 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00901  multidrug resistance efflux pump protein  53.16 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.23 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  47.53 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.76 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.73 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.56 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  47.3 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.65 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.9 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.26 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.83 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.63 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  45.55 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.33 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.79 
 
 		 533 aa  349  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.96 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.99 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.8 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.59 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.33 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.13 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.332659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0563  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.54 
 
 		 519 aa  319  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  39.89 
 
 		 547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  37.77 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.46 
 
 		 560 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5243  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 		 537 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6272  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.5 
 
 		 558 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.397121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.7 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6558  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.83 
 
 		 591 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1281  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.27 
 
 		 561 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183207  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6550  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.08 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1620  Outer membrane protein  40.52 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1798  hypothetical protein  40.52 
 
 		 569 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1641  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  40.52 
 
 		 569 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  37.79 
 
 		 569 aa  276  9e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5523  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.32 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.04 
 
 		 502 aa  269  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  34.74 
 
 		 489 aa  269  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0284  outer membrane efflux family protein  36.03 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  34.53 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1737  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.18 
 
 		 509 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.13 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.26 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  36.07 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2159  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.5 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.19 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.03 
 
 		 486 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.7 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  33.95 
 
 		 558 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.55 
 
 		 546 aa  253  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.81 
 
 		 482 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 504 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  37.01 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0034  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.07 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.677331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.13 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.58 
 
 		 496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.15 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.67 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.6 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.13 
 
 		 509 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3212  putative outer membrane protein  31.4 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.28 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.42 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.11 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.7 
 
 		 510 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.7 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  34.7 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.98 
 
 		 520 aa  226  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  34.7 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  34.7 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  34.7 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3604  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.83 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.37 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  35.18 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.84 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4060  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.4 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  34.57 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2436  hypothetical protein  31.71 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.68 
 
 		 501 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.82 
 
 		 496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.34 
 
 		 496 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1481  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.37 
 
 		 491 aa  223  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.290116  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.34 
 
 		 496 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.43 
 
 		 488 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.23 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.61 
 
 		 521 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2582  hypothetical protein  31.08 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2115  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.92 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308485  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1863  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.85 
 
 		 489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0805796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.98 
 
 		 471 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.4 
 
 		 518 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0630  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.48 
 
 		 569 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00465168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1728  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.76 
 
 		 509 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1918  outer membrane efflux protein  34.3 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5852  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.81 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.741914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>