More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0310 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0310  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
461 aa  919    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0728642  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  71.73 
 
 
465 aa  689    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.7 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  30.71 
 
 
492 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  28.69 
 
 
482 aa  176  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.28 
 
 
496 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  30.71 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  27.16 
 
 
460 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.39 
 
 
477 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  26.85 
 
 
486 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.33 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.17 
 
 
505 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26 
 
 
496 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.13 
 
 
481 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.29 
 
 
495 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.33 
 
 
517 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.22 
 
 
531 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.67 
 
 
519 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.67 
 
 
543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.56 
 
 
482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.68 
 
 
496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.68 
 
 
496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.82 
 
 
484 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.82 
 
 
484 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.57 
 
 
482 aa  164  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.71 
 
 
525 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.3 
 
 
483 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.37 
 
 
464 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.11 
 
 
500 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.88 
 
 
504 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  27.79 
 
 
479 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
514 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
514 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
512 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
514 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.17 
 
 
486 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  27 
 
 
553 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  27 
 
 
512 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  27 
 
 
512 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
514 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  26.98 
 
 
514 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.01 
 
 
487 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 
514 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.98 
 
 
551 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  26.98 
 
 
514 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.06 
 
 
484 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  26.98 
 
 
512 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  26.98 
 
 
512 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  26.38 
 
 
491 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.58 
 
 
483 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 
484 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.52 
 
 
507 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.98 
 
 
515 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  27.67 
 
 
487 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 
486 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.47 
 
 
507 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  27.61 
 
 
480 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  24.43 
 
 
483 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.45 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.06 
 
 
489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.8 
 
 
515 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
512 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.17 
 
 
475 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.75 
 
 
510 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.11 
 
 
510 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.15 
 
 
503 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.75 
 
 
476 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.11 
 
 
510 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.11 
 
 
470 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
507 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.27 
 
 
472 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.34 
 
 
476 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.18 
 
 
482 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.96 
 
 
489 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.68 
 
 
484 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  26.03 
 
 
493 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.25 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.25 
 
 
484 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  24.83 
 
 
508 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.27 
 
 
475 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.22 
 
 
511 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.16 
 
 
523 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  25.64 
 
 
485 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  28.12 
 
 
496 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  26.38 
 
 
499 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  25.64 
 
 
485 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  26.3 
 
 
498 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.52 
 
 
507 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.05 
 
 
495 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.52 
 
 
507 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.16 
 
 
477 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 
467 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.52 
 
 
507 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.03 
 
 
484 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.06 
 
 
477 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 
569 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.91 
 
 
496 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  25.74 
 
 
474 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.96 
 
 
470 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>