240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1170 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1170  putative outer membrane protein TolC  100 
 
 		 419 aa  841    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  47.82 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  49.02 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  23 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.84 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.93 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.17 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  23.8 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  23.8 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  23.8 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  23.8 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  23.95 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  25.52 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 		 449 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.95 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.51 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  24.07 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.4 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23 
 
 		 497 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.74 
 
 		 453 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.51 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  25.23 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.28 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  24.87 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  24.4 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  22.31 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.02 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  21.28 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  22.99 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.7 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  23.25 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.06 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.96 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.32 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.22 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.64 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.41 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.51 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  23.49 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  24.06 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  23.49 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.49 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  23.49 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  23.49 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  23.49 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.49 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  23.49 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  23.49 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.09 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  24.24 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.86 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.51 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.51 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  22.54 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0718  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.87 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  21.88 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  24.94 
 
 		 494 aa  67  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.25 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.74 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  23.17 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.85 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22.6 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.11 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.22 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  22.5 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  21.39 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  21.39 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0058  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  21.44 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2494  outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.76 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.33 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.05 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  21.31 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.3 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.3 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.3 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.3 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.3 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.86 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  23 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.25 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.71 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.06 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  22.41 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>