More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0058 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0058  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  100 
 
 		 456 aa  920    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  23.62 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.75 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.46 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  23.87 
 
 		 482 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.43 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.45 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  22.89 
 
 		 479 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.67 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.6 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.67 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.32 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.4 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.88 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.48 
 
 		 477 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.08 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  20.93 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  20.88 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.94 
 
 		 488 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.89 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  18.69 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  18.69 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.99 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  23.46 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.35 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  25 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  20.1 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.18 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  17.11 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  20.77 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.59 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  23.77 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  23.52 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.31 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.07 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  21.29 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.79 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  21.68 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  21.68 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  21.68 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  21.68 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  25 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  21.68 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  21.8 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.65 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  19.12 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.59 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.55 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.17 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  20.7 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.39 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.66 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  21.52 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  22.2 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  22.79 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  22.25 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  23.33 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.22 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.73 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  23.33 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  23.33 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.83 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.36 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.83 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  20.72 
 
 		 616 aa  67  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  22.42 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.22 
 
 		 616 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.83 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.45 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.92 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  22 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3453  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.12 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.67 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  22 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  22 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  18.49 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.9 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.04 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  23.08 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  22 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.71 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  22 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  22 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.29 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  22 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  22 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  19.3 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.09 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.32 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>