More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0814 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 455 aa  929    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  59.67 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  47.73 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  31.14 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  29.09 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.71 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.41 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.65 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.89 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1470 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1119  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.81 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.89 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.39 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.25 
 
 		 505 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.87 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.65 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  26.15 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.49 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.06 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  24.23 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  24.23 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  24.23 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.56 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.55 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.02 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  23.77 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  21.65 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.08 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.86 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.81 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.81 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.9 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.5 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  25.3 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  25.3 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.3 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.3 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.3 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.06 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.81 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  23.39 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  23.81 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.39 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.13 
 
 		 507 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.3 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  23.81 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  23.81 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  23.81 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.3 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.48 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.86 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.86 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.33 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.85 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.87 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.02 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.02 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.87 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.86 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.12 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.12 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.12 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.83 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1069  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.2 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  24.15 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.15 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>