23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1739 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 400 aa  767    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  46.83 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  35.78 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  32.92 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 		 421 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 		 421 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  32.86 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  33.16 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  34.69 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  32.05 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  33.9 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  32.78 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  25.58 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  28.61 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  26.98 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  33.49 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  28.51 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  20.24 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  29.84 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>