41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1748 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  100 
 
 		 395 aa  763    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  36.34 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  36.57 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  36.57 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  33.49 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  34.73 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  39.8 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  34.67 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  34.42 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  34.26 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  28.61 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  26.88 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  34.19 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  32.49 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  29.06 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.57 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.88 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 485 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  24.37 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.73 
 
 		 494 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.82 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.76 
 
 		 523 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>